微陣列芯片(Microarray)是一種高通量的生物技術(shù)工具,主要用于檢測(cè)和診斷基因表達(dá)水平、DNA變異等。它能夠同時(shí)檢測(cè)數(shù)千至數(shù)萬個(gè)樣品上百萬個(gè)生物分子特征,是生物學(xué)研究中必不可少的實(shí)驗(yàn)儀器之一。
1.微陣列芯片是什么
微陣列芯片是一種晶體管芯片,由硅基底材料制成。其表面覆蓋有成千上萬個(gè)光探測(cè)區(qū)域,每個(gè)區(qū)域都可以加入一種或多種具有特定功能的分子探針,如DNA、RNA或蛋白質(zhì)等。探測(cè)區(qū)域上的分子與待檢測(cè)的樣品分子結(jié)合后,可以通過信號(hào)放大技術(shù)進(jìn)行檢測(cè)和分析,從而得到關(guān)于樣品的信息。
2.微陣列芯片分類
根據(jù)不同的應(yīng)用場(chǎng)景和功能需求,微陣列芯片可以分為多種類型,如:
- 基因表達(dá)芯片:用于檢測(cè)不同組織或條件下基因的表達(dá)情況,以及不同個(gè)體之間基因表達(dá)的差異。
- SNP芯片:用于檢測(cè)單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphism),從而研究基因與疾病的關(guān)系。
- 蛋白質(zhì)芯片:用于檢測(cè)不同組織或條件下的蛋白質(zhì)表達(dá)水平,以及不同生物體內(nèi)蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)的變化。
- 藥物篩選芯片:用于高通量地篩選小分子化合物對(duì)特定分子靶點(diǎn)的親和性和效價(jià)。
3.微陣列芯片應(yīng)用流程
微陣列芯片的應(yīng)用流程主要包括實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、樣品處理、雜交反應(yīng)、芯片掃描和數(shù)據(jù)分析等步驟:
- 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì):根據(jù)研究問題確定實(shí)驗(yàn)方案,比如選擇適當(dāng)?shù)男酒愋?、探針設(shè)計(jì)和樣品來源等。
- 樣品處理:將待測(cè)樣品提取RNA或DNA,并進(jìn)行標(biāo)記或放大。
- 雜交反應(yīng):通過液相雜交或固相雜交方式將標(biāo)記后的樣品與芯片上的探針結(jié)合,并進(jìn)行洗滌和染色。
- 芯片掃描:使用芯片掃描儀讀取芯片上每個(gè)探測(cè)區(qū)域的熒光信號(hào),并將其轉(zhuǎn)化為數(shù)字?jǐn)?shù)據(jù)。
- 數(shù)據(jù)分析:對(duì)得到的大量數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理、統(tǒng)計(jì)學(xué)分析和生物信息學(xué)分析,從而得到樣品數(shù)據(jù)庫、差異基因或蛋白質(zhì)等存在意義的結(jié)果。