基因芯片是一種先進的高通量實驗工具,能夠大規(guī)模地測定生物體內(nèi)的基因表達情況。其基本原理是通過將數(shù)以萬計的DNA探針或cDNA探針固定在微型化的芯片上,利用這些探針對樣品中所有基因進行檢測。基因芯片被廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)領(lǐng)域,如基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等。
1.基因芯片原理
基因芯片的原理是利用互補配對的原則,將已知的DNA序列探針(或cDNA探針)與待檢測樣品中的RNA雜交,并根據(jù)雜交程度來測定各個基因在樣品中的表達情況。通常,每種特定的基因芯片都包含成千上萬條不同的DNA或cDNA探針序列,并且可以同時測試多個樣品?;蛐酒蕾嚨募夹g(shù)包括生物芯片技術(shù)、分子生物學(xué)、微電子學(xué)、光學(xué)、計算機科學(xué)等多個學(xué)科。
2.基因芯片的分類
基因芯片主要可分為兩類:單色基因芯片和熒光基因芯片。單色基因芯片指的是使用一種染料來標(biāo)記樣本,而熒光基因芯片則是利用不同顏色的熒光標(biāo)記劑來同時檢測多個樣品。根據(jù)探針序列的來源不同,基因芯片可以分為兩種類型:cDNA芯片和寡核苷酸芯片。cDNA芯片以已知的全長基因序列為基礎(chǔ),在芯片上固定該基因的cDNA探針序列來進行檢測;寡核苷酸芯片則采用短寡核苷酸探針覆蓋全基因組,比cDNA芯片具有更高的檢測覆蓋率。
3.基因芯片的應(yīng)用領(lǐng)域
基因芯片被廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)領(lǐng)域中,既可以用于研究基因表達,也可以用于研究基因變異、蛋白結(jié)構(gòu)和細胞信號傳導(dǎo)等方面的問題。例如,在藥物研發(fā)領(lǐng)域,基因芯片可以幫助確定治療方案和開展新藥研究。在臨床醫(yī)學(xué)中,基因芯片可作為疾病診斷的輔助手段,例如通過檢測腫瘤細胞中特定基因的表達水平來確定病人是否需要進行進一步治療。